过滤器是雨水收集系统中的关键组件，可以去除大部分污染物，从树枝和树叶到微观碎片。选择哪种过滤器类型取决于所收集的水量，大型商业系统需要比相对简单的家用系统更复杂的设备。
传统上，最简单的是在排水管口覆盖一些网，但这并不理想，因为它很快就会堵塞。如今的自动清洗过滤器，几乎不需要排空或维护，并且不断地工作以确保储罐没有碎屑。
雨水过滤器用于雨水收集系统中的两个作用：
一、预处理。在水进入储存系统之前去除尽可能多的物理污染物，罐内过滤是预处理罐系统的一种变化，可以看到过滤器部署在储罐内但与外部预罐过滤器具有相同的效果。
二、过滤净化。在水离开储存系统后，罐后过滤涉及额外的颗粒过滤，并通过管道输送到应用点，例如饮用水出口。
雨水过滤器的几种类型：
这些过滤器最重要的功能是防止碎屑进入水箱，因此过滤网越精细越有助于保持峰值质量并抑制厌氧细菌的发展，厌氧细菌可导致令人不愉快的气味。
这些设计用于提取水并将其转移到存储系统，同时留下碎屑继续沿着管道向下流动。通过这些下水管过滤器的绝大部分水（大约95%）被收获， 从而最大限度地减少了水的流失。
巧妙的设计使水围绕网状物旋转并防止任何大于0.28毫米的颗粒进入储罐。
这些涡旋过滤器的一个重要附加功能是在过滤水时给水充氧。
水箱式过滤器采用独特设计，在水平单元内采用与涡旋过滤器相同的技术，在最小的反转损耗范围内，非常有效地去除碎屑。
因为早期的过滤器预计已经去除了大于一定尺寸的物理碎片。当需要使用紫外线消毒装置将水质从非饮用水提高到更高质量时，颗粒过滤器尤为重要。紫外线通过破坏DNA来中和微生物和病原体对健康的危害。
用于改善水的味道和气味。